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utilisation de la pcr multiplex pour la detection des virus et bacteries atypiques chez les enfants presentant des infections respiratoires aigues (ira)

Faculte De Medecine — Biologie et Ecologie Végétales — None ()

Auteur : rabezanahary henintsoa manarivo

Année de soutenance : 2011

Diplome : DEFS

Langue : FR

Résumé

cette étude prospective a été menée dans le sud-est de madagascar, chez les enfants âgés de 2- 59 mois venus consulter à la fondation médicale d’ampasimanjeva (fma) pour ira, entre février 2010 et février 2011. les objectifs de cette étude ont été ainsi de (1) déterminer l’implication virale et bactérienne atypique dans les ira en utilisant comme outil de diagnostic la rt-pcr multiplex, (2) de décrire l’aspect épidémio-clinique des pathogènes retrouvés et (3) de préciser la place de la pcr dans le diagnostic des ira. chacun des épisodes d’ira a été, dans un premier temps, classé en fonction de différentes catégories de manifestations cliniques, à savoir les infections respiratoires aiguës basses (irab), les syndromes grippaux et les infections respiratoires hautes (irh). un diagnostic par rt-pcr multiplex a été effectué en parallèle du diagnostic clinique permettant de détecter 18 virus respiratoires et 2 bactéries atypiques à partir d’écouvillonnages naso-pharyngés. ainsi, sur les 295 enfants inclus dans l’étude, des virus et/ou des bactéries atypiques ont été détectés dans 75% des cas (220/295). les virus les plus fréquemment détectés ont été des rhinovirus (21%) et des métapneumovirus (14%). les co-détections virales ont été présentes chez 20% des cas (60/295). les métapneumovirus a/b ont été principalement détectés au cours d’une pneumonie (17/83 ; 21%), les virus parainfluenza (18/95; 19%) ont été détectés au cours des autres cas d’irab, les rsva/b ont été plutôt retrouvés au cours d’un syndrome grippal (15/66; 23%) et les adénovirus (8/51; 16%) ont été plus fréquents au cours d’une irh. différentes distributions saisonnières ont été également associées à chacun des virus identifiés. l’utilisation de la pcr a permis d’augmenter notre connaissance sur l’implication et l’importance des virus dans les ira