Theses et Memoires de l'universite d'Antananarivo

Resume

l’infection au vih constitue encore actuellement une pandémie mondiale préoccupante et dont les deux tiers des nouvelles infections proviennent de l’afrique subsaharienne. a madagascar, le taux de prévalence du vih chez les adultes de 15 à 49 ans est de 0,4% (ic95%: 0,3%-0,5%) selon les dernières enquêtes épidémiologiques. bien que le pays fasse toujours partie des pays à faible prévalence (<1%), l’épidémie vih y est pourtant concentrée et est particulièrement élevée chez certains groupes de population clé, tels les hommes ayant des rapports sexuels avec les hommes (14,7% en 2010). la riposte nationale au vih/sida priorise la prévention de l’infection au vih et la prise en charge des personnes vivant avec le vih. c’est dans ce deuxième volet prioritaire de la lutte nationale contre le vih/sida que s’insère la présente recherche. les deux (2) objectifs principaux de cette recherche consistent (i) à mettre en place les outils virologiques moléculaires vih au laboratoire national de référence (lnr) et (ii) à déterminer les caractéristiques virologiques de l’infection au vih en vue de l’amélioration de la prise en charge biologique des personnes vivant avec le vih à madagascar. l’inclusion des 401 patients de 2008 à 2012 et des 109 hommes ayant des relations sexuelles avec les hommes (hsh) suivait le protocole inscrit dans les conventions de partenariat tripartite entre le lnr/ministère de la santé publique, le laboratoire de virologie du chu necker enfants malades et l’ong solthis. les techniques de mesure de la charge virale vih, la méthode generic hiv charge virale biocentric© et la méthode cobas taqman©, pour le suivi virologique des patients ont été mises en place au lnr. la pcr adn en temps réel pour le dépistage précoce du vih a été également mise en place au lnr. les analyses de génotypage par séquençage ont été réalisées au laboratoire de virologie du chu necker pour le lnr. les sous-types de vih ont été déterminés dans le site du national center for biotechnology information, organisme américain (ncbi) avec la portion du gène rétrotranscriptase et les interprétations des mutations de résistance ont été faites selon les algorithmes de l’anrs et de stanford. les mesures de la charge virale vih avec à la fois la méthode generic hiv charge virale biocentric© et la méthode cobas taqman© ainsi que la détection qualitative de l’adn proviral par pcr en temps réel avec la méthode generic hiv dna cell biocentric© ont été bien implantées au lnr. les 66,8% des patients ont eu des analyses de génotypage moléculaire. les sous-types c (31%), b (22%) et a1 (19%) sont les sous-types de vih prédominant à madagascar. quatre formes recombinantes, crf02_ag, crf06_cpx, crf15_01b et le crf15_01b et les sous-types f divergent et g divergent étaient également retrouvées dans nos échantillons. concernant l’efficacité de la prise en charge thérapeutique des patients, seuls les 35% des patients traités depuis plus de 6 mois avaient un succès virologique. le quart des patients ayant des séquences disponibles avait au moins une mutation de résistance aux inhibiteurs nucléosidiques ou non-nucléosidiques de la transcriptase inverse (inti et innti) ou inhibiteurs de la protéase (ip). les 72,2% des patients portant des virus résistants aux inti avaient des mutations t215d ou t215e conférant la résistance aux zidovudine (azt) et stavudine (d4t). la moitié des patients portant des virus résistants aux innti étaient résistants aux efavirenz (efv) et névirapine (nvp). la résistance aux ip est rare chez les patients, un patient était résistant à la fois au nelfinavir (nfv) avec la mutation d30n et à indinavir (idv) avec la mutation m46i. une résistance primaire de la combinaison de mutations 210w et 215d était observée chez des patients naïfs de traitement et ces mutations sont associées significativement au sous-type b (p<0,001). une fréquence élevée de cette transmission de résistance primaire était constatée dans la région de diana (25%, ic95%: 10-44%). les 95,1% (39/41) des virus résistants avaient les mutations l210w et t215d et étaient tous des sous-types b. l’infection au vih à madagascar est très riche en diversité génétique et est marquée particulièrement par l’existence d’une transmission de résistance primaire. la détermination de ces caractéristiques virologiques de l’infection au vih du pays, qui sont d’une utilité de santé publique, contribuera à l’amélioration de la riposte nationale au vih.

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