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caracterisations phenotypique et genotypique d'enterobacteries resistantes aux cephalosporines de troisieme generation isolees dans un service de neonatalogie

Faculte Des Sciences — Biochimie Fondamentale et Appliquée — None ()

Auteur : rabenandrasana mamitina alain noah

Année de soutenance : 2015

Diplome : MASTER 2

Langue : FR

Résumé

les antibiotiques ont permis de lutter contre les maladies infectieuses d’origine bactérienne, toutefois leur utilisation parfois abusive ou incontrôlée a provoqué l’émergence des bactéries résistantes. cette étude avait pour objectif d’étudier la dynamique de transmission des entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération (ebrciiig) dans un service de néonatalogie. c’est un suivi d’une cohorte prospective constituée de dix nouveau-nés et de dix accompagnants durant trois mois dans un service de néonatalogie. les prélèvements utilisés étaient : des écouvillonnages rectaux des nouveau-nés, des appositions de doigts et émissions de selles des accompagnants et des écouvillonnages environnementaux.ces prélèvements ont été cultivés sur le milieu chromagar esbl et chaque morphotype de colonie a été identifié par un spectromètre de masse maldi-tof. un antibiogramme a été réalisé pour chaque souche incluant le test de double synergie et d’inhibition à l’edta pour détecter respectivement les bêtalactamases à spectre étendu (blse) et les métallobêtalactamases. des amplifications pcr ont été effectuées pour rechercher des gènes de résistance ctx-m du groupe 1, du groupe 9 et tem chez toutes les souches isolées. les gènes codant pour les enzymes vim, ndm-1 et oxa-23 ont été recherchés chez les souches suspectées de produire une carbapénèmase, et les gènes estia, estib, elt spécifiques des etec et le gène escv spécifique des stec, eiec et atec pour déterminer les pathotypes des escherichia coli isolés et producteurs de blse . les transmissions de souches entre accompagnants et nouveau-nés ont été étudiées par une technique de génotypage : la rep pcr. les analyses bactériologiques ont montré que le portage rectal d’ebrciiig était élevé ((79,3 % (23/29) chez les nouveau-nés ; 72,2 % (13/18) chez les accompagnants) à la sortie, la proportion était moindre sur les doigts du personnel soignant et accompagnants (25% (6/24)) et dans l’environnement hospitalier – surfaces - (5,1% (2/39)). les espèces majoritairement isolées étaient des klebsiella pneumoniae, enterobacter cloacae et escherichia coli (88%). la proportion des souches isolées sur chromagar esbl et productrices de blse était de 93% (55/59) chez les nouveau-nés et 88% (38/43) chez les accompagnants. des souches qui produisaient une métallobêtalactamase ont été retrouvées chez les nouveau-nés 2% (1/59) et dans l’environnement 66.6% (2/3). les gènes de résistance détectés chez les souches productrices de blse étaient des gènes ctx-m du groupe 1 (83% chez les nouveau-nés et 84% chez les accompagnants), tem (3% chez les nouveau-nés et 2% chez les accompagnants) et ctx-m du groupe 9 (2% chez accompagnants). aucune des souches d’escherichia coli n’appartenait aux pathotypes etec, stec, epec et atec. l’analyse des profils rep pcr a suggéré la transmission directe de deux stenotrophomonas maltophilia, sept klebsiella pneumoniae et deux enterobacter cloacae respectivement entre nouveau-nés et accompagnants, entre accompagnants et entre nouveau-nés. cette étude a permis de démontrer l’existence et la transmission d’entérobactéries résistantes aux céphalosporines de troisième génération au sein du service de néonatalogie.