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selection et caracterisation de souches d'actinomycetes isolees a partir des rhizomes et du sol rhizospherique de gingembre ayant des activites biologiques comparables a celles de son huile essentielle

Faculte Des Sciences - nan - None ()

Auteur : andriambeloson herivony onja

Annee de soutenance : 2016

Diplome : DOCTORAT

Langue : FR

Resume

les plantes et les microorganismes endophytes ou ceux du sol rhizosphérique sont depuis longtemps connus pour les relations bénéfiques qu’ils présentent les uns envers les autres. les deux organismes sont connus par leur production en métabolites secondaires bioactifs dont la similarité a été démontrée dans quelques travaux de recherche. la présente étude se focalise sur l’isolement et la caractérisation des actinomycètes à partir des rhizomes et du sol rhizosphérique de gingembre, présentant des activités biologiques comparables à celles de l’extrait actif de la plante (huile essentielle de gingembre). soixante trois souches d’actinomycètes ont été isolées des rhizomes et du sol rhizosphérique de deux plantations rurales de gingembre de soavinandriana itasy selon des méthodes d’isolement sélectives sur milieu as1 agar. les tests d’activités biologiques ont montré que parmi les 63 isolats, 16 souches dont 2 endophytes et 14 issus du sol rhizosphérique de gingembre ont présenté une activité antimicrobienne contre au moins un germe-test. les souches sont plus actives vis-à-vis des bactéries gram+ et les champignons que vis-à-vis des bactéries gram-. une seule souche isolée du sol rhizosphérique de gingembre du site n°2 (s18) a inhibé le développement de tous les germes-tests utilisés. les tests réalisés sur six souches représentatives sélectionnées sur la base des tests de l’activité antimicrobienne ont montré que les extraits issus des isolats s3 et s43 possèdent une forte activité antiproliférative sur les cellules ht-20 (cancer du colon) avec des valeurs d’ic50 de 5&#956;g/ml et de 2,2&#956;g/ml, respectivement ; une forte activité antipaludique contre la souche de plasmodium falciparum chloroquino-résistante (ic50=1,25&#956;g/ml pour l’extrait s3 et 2,5<ic50<5&#956;g/ml pour l’extrait s43) et une activité antioxydante (ic50=15mg/ml pour l’extrait s3 et 10,6mg/ml pour l’extrait s43). d’autre part, les deux huiles essentielles testées ont présenté une activité antimicrobienne vis-à-vis de tous les germes-tests utilisés et une activité antioxydante. seule, l’huile essentielle de gingembre du site n°2 a exhibé un potentiel anticancéreux modéré (ic50=14&#956;g/ml) sur les cellules cancéreuses du colon et une forte activité antiplasmodiale (2,5<ic50<5&#956;g/ml). l’isolat s43 a ainsi montré des activités biologiques comparables et plus fortes que celles de l’huile essentielle de gingembre du site n°2. le criblage chimique préliminaire de ces deux extraits a révélé la présence commune de terpènes et de composés phénoliques. l’identification des 4 souches représentatives basée sur l’étude des caractères phénotypiques a montré que ces souches se rapprochent du genre streptomyces. l’identification moléculaire basée sur le séquençage du gène codant l’arnr 16s ainsi que l’analyse phylogénétique a confirmé que les souches représentatives appartiennent aux espèces du genre streptomyces.

Mots cles

sol rhizospherique activites biologiques huile essentielle biologiques comparables activites biologiques comparables activite antimicrobienne souches representatives forte activite