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mise au point de techniques moléculaires pour la détection d'herpesvirus et de mycoplasma chez les tortues terrestres endémiques de madagascar

Faculte Des Sciences — Biochimie Fondamentale et Appliquée — None ()

Auteur : rasoanarivo liantsoa sahazaniaina anjaralahatra fifaliana

Année de soutenance : 2017

Diplome : MASTER 2

Langue : FR

Résumé

les maladies respiratoires sont parmi les causes de déclin de la population des tortues terrestres dans le monde. ces maladies sont dues principalement aux herpesvirus et aux mycoplasma. cette étude a pour objectif de mettre au point des techniques moléculaires pour la détection de ces deux agents pathogènes chez deux espèces de tortues terrestres endémiques de madagascar, astrochelys yniphora et pyxis planicauda. la mise au point de techniques de détection moléculaire d’herpesvirus et de mycoplasma a été effectuée à partir de contrôles positifs d’adn fixé sur papier buvard et d’adn en solution avec trois types de pcr (conventionnelle, semi-nichée et nichée). des échantillons de lavage nasal de tortues (275), composés de 182 astrochelys yniphora et 93 pyxis planicauda, ont été ensuite analysés avec les pcr mises au point après optimisation de la technique d’extraction d’adn. les résultats des pcr effectuées sur les contrôles positifs ont montré une meilleure détection d’herpesvirus après la pcr nichée et de mycoplasma après la pcr conventionnelle. l’efficacité de l’extraction d’adn des échantillons de tortues a pu être évaluée grâce à une pcr ciblant les gènes de ménage des tortues. ces gènes de ménage ont été détectés dans 159 extraits d’adn parmi les 275. les procédures d’échantillonnage des prélèvements des tortues pourraient influencer ces résultats. après pcr spécifiques pour herpesvirus et mycoplasma, aucun résultat positif n’a été observé. bien que seulement 57,8 % (159/275) des résultats ont été validés, la mise au point des pcr spécifiques pour herpesvirus et mycoplasma a permis d’analyser les échantillons de tortues terrestres endémiques de madagascar. les tortues avec les résultats validés seront relâchées dans la nature. cependant, il faut tenir compte de la présence d’autres agents pathogènes qui pourraient être néfastes pour ces tortues.