mise au point de techniques moléculaires pour la détection d'herpesvirus et de mycoplasma chez les tortues terrestres endémiques de madagascar
Faculte Des Sciences — Biochimie Fondamentale et Appliquée — None ()
Auteur : rasoanarivo liantsoa sahazaniaina anjaralahatra fifaliana
Année de soutenance : 2017
Diplome : MASTER 2
Langue : FR
Résumé
les maladies respiratoires sont parmi les causes de déclin de la population des tortues terrestres dans le monde. ces maladies sont dues principalement aux herpesvirus et aux mycoplasma. cette étude a pour objectif de mettre au point des techniques moléculaires pour la détection de ces deux agents pathogènes chez deux espèces de tortues terrestres endémiques de madagascar, astrochelys yniphora et pyxis planicauda. la mise au point de techniques de détection moléculaire dherpesvirus et de mycoplasma a été effectuée à partir de contrôles positifs dadn fixé sur papier buvard et dadn en solution avec trois types de pcr (conventionnelle, semi-nichée et nichée). des échantillons de lavage nasal de tortues (275), composés de 182 astrochelys yniphora et 93 pyxis planicauda, ont été ensuite analysés avec les pcr mises au point après optimisation de la technique dextraction dadn. les résultats des pcr effectuées sur les contrôles positifs ont montré une meilleure détection dherpesvirus après la pcr nichée et de mycoplasma après la pcr conventionnelle. lefficacité de lextraction dadn des échantillons de tortues a pu être évaluée grâce à une pcr ciblant les gènes de ménage des tortues. ces gènes de ménage ont été détectés dans 159 extraits dadn parmi les 275. les procédures déchantillonnage des prélèvements des tortues pourraient influencer ces résultats. après pcr spécifiques pour herpesvirus et mycoplasma, aucun résultat positif na été observé. bien que seulement 57,8 % (159/275) des résultats ont été validés, la mise au point des pcr spécifiques pour herpesvirus et mycoplasma a permis danalyser les échantillons de tortues terrestres endémiques de madagascar. les tortues avec les résultats validés seront relâchées dans la nature. cependant, il faut tenir compte de la présence dautres agents pathogènes qui pourraient être néfastes pour ces tortues.