Université d’Antananarivo

Résumé

cryptococcus neoformans est une levure encapsulée responsable de la méningoencéphalite mortelle chez les personnes immunodéprimées et notamment les patients infectés par le vih. à madagascar l’épidémiologie de la cryptococcose était très peu documentée avant qu’une étude sur sa prévalence et ses facteurs de risque chez les patients infectés par le vih conduite par le service des maladies infectieuses de l’hôpital universitaire joseph raseta befelatanana (hujrb), antananarivo et le centre d’infectiologie charles mérieux (cicm), université antananarivo, ait été mise en place en août 2014. dans ce travail, nous avons repris 13 souches de cryptococcus neoformans isolées dans le cadre de cette étude, dans l’objectif d’analyser d’un point de vue moléculaire la région its (internal transcribed spacer) du génome, pour identifier le(s) génotype(s) de cryptococcus neoformans circulant(s) à madagascar. nous avons extrait l’adn fongique, puis amplifié et séquencé la région its du génome de 578 pb. grâce à l’application d’outils bio-informatiques développés par genbank et isham its database, le génome des souches analysées a été identifié étroitement lié à cryptococcus neoformans var. grubii. en conclusion, le séquençage de la région its est une méthode efficace et précise pour différencier l’espèce et la variété de cryptococcus spp. une perspective d’analyse du génome par technique mlst (multi-locus sequence typing) est envisagée afin de préciser ses caractères phylogénétiques par rapport à d’autres pays.