Université d’Antananarivo

Résumé

xenopsylla cheopis est une espèce de puce connue comme étant le vecteur majeur de la maladie peste à madagascar. une étude phylogéographique sur cette espèce assure l’acquisition des connaissances sur sa diversité génétique, la distribution géographique de ses populations et plus loin, son mode de dispersion à l’échelle nationale. dans cette étude, les objectifs principaux ont été de mettre au point par pcr les différents marqueurs moléculaires (nucléaire et mitochondriaux) potentiellement convenables pour des études de diversité génétique et de réaliser une étude préliminaire sur la phylogéographie de cette puce vectrice dans l’île. pour ce faire, l’extraction de l’adn a été réalisée sur les spécimens. trois marqueurs mitochondriaux (coi, coii et coi-tailed) et un marqueur nucléaire (28s) ont été mis au point par amplification pcr. une fois que les conditions optimales ont été identifiées, des échantillons en provenance de 24 sites (21 à madagascar et 3 dans les iles voisines) ont été amplifiés utilisant le marqueur coi-tailed puis, les amplifiats obtenus ont été séquencés. suite au séquençage et au nettoyage des séquences, 153 séquences nucléotidiques ont été obtenues. les analyses des données de séquences ont permis de révéler la présence de 19 haplotypes dans les sites échantillonnés avec l’haplotype h2 qui est présent dans tous les sites sauf à farafangana. la répartition géographique de ces haplotypes est hétérogène. globalement, la similarité nucléotidique varie entre 66 - 100% toutefois, la majorité des valeurs de similarité se trouve à environ 100%. ceci concluant la présence de diversité génétique inter- et intrapopulation de xenopsylla cheopis dans ces sites d’étude, plus généralement à madagascar.