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risque pesteux dans les foyers ruraux du moyen ouest malgache : deplacements et structuration des populations de rats noirs rattus rattus (linnaeus, 1758) de l'echelle de l'habitat a celle du paysage

Faculte Des Sciences - nan - None ()

Auteur : rahelinirina soanandrasana

Annee de soutenance : 2009

Diplome : DOCTORAT

Langue : FR

Resume

la peste, maladie aujourd’hui considérée comme ré émergente dans le monde est une préoccupation de santé publique à madagascar. en effet, une quarantaine de districts est touchée par cette zoonose. des cas sont régulièrement déclarés dans des foyers ruraux des hautes terres centrales, notamment dans la région du vakinankaratra. le paysage typique de ces foyers est constitué des maisons entourées des haies de sisal en haut de la colline, des cultures sur brûlis sur la pente et des rizières dans les bas fonds. le rat noir est le principal réservoir dans ces foyers. une étude antérieure sur la dynamique des populations des rats noirs avait montré que ces derniers sont particulièrement abondants dans les haies de sisal et que les espèces de puces qu’ils hébergent sont différentes selon l’habitat (xenopsylla cheopis dans les maisons et synopsyllus fonquerniei à l’extérieur). dans le cadre de l’étude du risque pesteux dans les foyers ruraux de la peste à madagascar, un suivi de déplacements des rats noirs a été mené dans les districts d’antsirabe ii et de betafo de septembre 2006 à juillet 2008 (durant les haute et basse saisons de transmission de la peste). deux marqueurs ont été utilisés: la rhodamine b incorporée à des appâts pour le suivi individuel des déplacements des rats noirs et les marqueurs microsatellites pour étudier la structuration génétique des populations. après des tests d’appétence et l’évaluation de la persistance de la rhodamine b au laboratoire, un suivi en conditions naturelles a été mené dans 31 villages. les appâts ont été déposés dans des boites de kartman dans 3 habitats (maison, haie de sisal et bas fond)durant 3 nuits. un mois après marquage, des séries de piégeages ont été effectuées tous les mois pendant 3 mois dans les 3 types d’habitat. les indicateurs de risque pesteux ont été déterminés au niveau de la population de rongeurs piégés : index pulicidien, séroprévalence en anticorps igg anti-f1, portage en yersinia pestis et portage en antigène f1. les résultats ont montré que lors de la période d’étude : (i) il n’y a pas d’effet de la rhodamine b sur l’abondance des rats noirs et des puces ; (ii) les maisons sont une source permanente de production de rongeurs : en haute saison de transmission, il existe un flux (10%) de rats à double sens entre maisons et haies de sisal; en basse saison de transmission, près de 50 % des rats de maison vont coloniser les autres habitats : haies de sisal (39%) et bas-fonds (11%) ;(iii) l’index pulicidien, la séroprévalence en anticorps anti-f1 et le portage en antigène f1 étaient important en haute saison de transmission de la peste ; (iv) x. cheopis et s. fonquerniei étaient porteuses de y. pestis en haute saison mais pas en basse saison ; (v) les rats se déplacent plus loin en saison de récolte qui correspond à la basse saison de la peste ; (vi) il n’y a pas de structuration génétique chez les rats entre habitats dans une même localité ; (vii)la distance géographique limite le flux génique dans ce paysage. les maisons, haies de sisal et les bas fonds sont tous des habitats à risque : présence des réservoirs, des vecteurs et de la bactérie. il existe des échanges importants de rats entre ces habitats : cela explique la faible structuration génétique observée localement, la capacité à reconstituer des populations après des épizooties de peste, la transmission de la maladie entre habitats et localités.

Mots cles

rats noirs risque pesteux foyers ruraux ont ete rats noirs rattus noirs rattus rattus rattus rattus linnaeus rattus linnaeus 1758